UltraMassExplorer

Interaktive, Browser-gestützte Auswertung hochauflösender Massenspektrometrie-Daten

Überblick

UME

  • ist ein browserbasiertes Open-Access-Tool, das eine vollständige hochauflösende massenspektrometrische Daten-Pipeline bereitstellt. 
  • bietet einen Summenformel-Algorithmus, ermöglicht die interaktive Exploration von Daten, errechnet zahlreiche State-of-the-Art Auswertungsparameter und ermöglicht den Export von Daten und Abbildungen.
  • umfasst eine Online-Schnittstelle zur chemischen Datenbank PubChem, um die Erforschung möglicher molekularer Strukturen zu erleichtern.
  • benötigt lediglich eine kalibrierte Massenliste mit den zugehörigen Intensitäten. Diese kann mit Hilfe der Fourier-Transformations-Ion-Zyklotron-, Obitrap- oder Time-of-Flight-Massenspektrometrie aufgenommen worden sein.

Zugang

Klicken Sie hier für den Zugang zu UltraMassExplorer (beta-Version; April 2018):

Hilfe & Download

Beispiel Peakliste

  • Peakliste (csv-Datei) mit 13 FT-ICR-MS Analysen (4 Gebiete; je 3 Proben; 1 Blank): download

R Skripte

Video tutorial